在第三季中最大的赢家非林肯莫属，不但自己和儿子都没事，还成功挖了詹姆斯的墙角喜提小女友一枚。他隐约感觉到自己被公司的人盯上了，就在拉着全家离开时却被公司的杀手堵了个正着。虽然将公司的特工杀死，但巨大的枪声引来了附近巡逻的警察，最终也被当地警方抓捕。
另一边的迈克还在四处打听萨拉的下落，他一个电话打给了萨拉父亲生前的朋友白爷，可惜电话刚接通一群警察就将他团团围住。迈克被带到了一个审讯室，和他见面的是国土安全局的高级特工泰罗，而詹姆斯正是他派到公司的卧底。现在他已经被杀害，所以希望迈克答应加入寻找锡拉的计划。
如今你的哥哥林肯已经被巴拿马警方逮捕，只要你答应，我们随时可以将他引渡回美国。见识到国土安全局的行动速度和实力，迈克开始心动了。但泰罗同时表示政府只有几个人知道这次行动，而我则是你们的直接联系人。你们得到锡拉之后，然后潜入戒备森严的公司总部将它破解。
正在迈克犹豫要不要加入时，有人斥巨资居然将兄弟俩保释了出去。原来此人正是萨拉父亲的朋友白爷。白爷将迈克带到一栋房子，推开门一看，站在对面的正是朝思暮想的萨拉。时隔多日，两人紧紧的拥抱在一起相拥而泣。这一晚他们整夜都腻在一起。
当看见萨拉背后被摧残的伤痕，迈克内心充满了心痛和自责。可突然一枚子弹射了进来，原来是公司的杀手黑哥赶到了。迈克终于明白，除非弄垮公司，否则他们这群人永远都没有安宁之日。
第二天一大早，迈克就见到了曾经的越狱小伙伴，这些人都是他加入锡拉计划的要求。泰罗给迈克等人都准备了新的身份，为了更好的隐藏自己，在没有使用镇痛剂的情况下，迈克忍着剧痛将满身的纹身全部清洗掉。但他们并不知道，此时的他们已经卷入一场更大的阴谋之中。这是两人被困在荒无人烟沙漠的第三天，失败。T-bag一边撕下手上的书籍充饥，一边鼓励小胖不要放弃活下去的希望。但万万没想到，趁着T-bag休息时，小胖竟然一棍子朝他薅了过来。
原来，小胖想要吃掉T-bag充饥，可惜饿的晕头转向的他，只是被T-bag轻轻一推就撞死在了石头上。看着小胖的尸体，T-bag无比的痛心。然而就在此时，一股邪恶的念头同样闪现在他的心头，地上就多了一堆燃起的篝火。他拼尽全力将小胖的尸体拖向火堆。纵使以前杀死过无数个人，但唯独这一次，让他第一次感觉到自己内心的丑恶。
又是三天过去了，但回想起来总是不由自主的作呕。沙丘背后突然传来一阵马达声，原来是两个玩山地越野的年轻人经过此地。看着T-bag这副狼狈不堪的样子，年轻人提出载他一程。在两名贵人的帮助下，T-bag终于顺利回到美国境内的圣地亚哥。
他之所以来到这座城市，是因为那本鸟类指南上标注了一串特殊的数字。按照书中的指示，T-bag成功找到一个共享储物柜，输入密码打开一看，里面是一些证件、银行卡以及资料之类的。加上又从报纸上得知，詹姆斯已经被人杀害。T-bag干脆一不做二不休，直接打起了冒用这个身份的想法。
根据资料显示，他搭上了一辆前往洛杉矶的大巴，寻着名牌上的地址，用那把钥匙打开了一个房间。看着屋子内豪华的陈设，T-bag抑制不住内心的狂喜。刮胡子的时候，回想起迈克曾经一次次耍自己的画面，是他害自己失去了左手，才会导致后续一系列的悲惨遭遇。
此时的迈克等人也来到了洛杉矶，众人来到一间废旧的仓库，泰罗给他们配备了一个队友。此人正是亚裔顶级黑客罗兰，名义上是辅助迈克等人破解锡拉中的秘密，实际上是泰罗安插在他们内部的眼线。
马宏第一个分享了自己的情报，他曾是詹姆斯和格雷琴的专职司机，公司得到锡拉之后，存放在公司的一名高管手里，也就是所谓的持卡人。自己也曾有幸见过持卡人的司机。可问题是，洛杉矶有1000万人，找到这名司机可谓是大海捞针。马宏不愧是前FBI顶级探员。接下来的一番推理，范围瞬间从1000万人缩小到了50人。通过国土安全局提供的信息，马宏一眼就从这50个人中认出了司机。没有片刻的停留，他们立马来到司机家门口蹲点，然后尾随他成功找到持卡人的住所。
这是一座像城堡一样的私人别墅，门口是运动传感器，周围布满了警报系统以及武装保安，就连一只苍蝇都飞不进去，更别提还是潜进去偷卡了。然而更糟糕的是，迈克总是莫名其妙的感觉头晕，猛然发现鼻子里竟然流出了黑色的鼻血。
